small RNA是生命活動重要的調控因子，在基因表達調控、生物個體發育、代謝及疾病的發生等生理過程中起著重要的作用,包括miRNA、piRNA和siRNA。
A．miRNA: 是一種長度為21～25nt的單鏈小分子RNA。它廣泛存在于真核生物中，成熟的miRNA是由具發夾結構單鏈RNA前體（pre miRNA）經過Dicer酶加工而成，主要通過與靶標基因不完全互補結合來調控靶基因的表達。miRNA在細胞發育、生物標志物、腫瘤等多個領域中有廣泛的應用。
B. piRNA: 是一類長度為26～31nt單鏈的小RNA，大部分集中在29～30nt。piRNA的表達具有組織特異性，只存在于具有全能性的動物細胞，如生殖細胞、腫瘤細胞和干細胞等。piRNA通過與Piwi亞家族蛋白結合形成piRNA復合物（piRC）來發揮生物學功能（沉默轉錄基因過程，維持生殖系和干細胞功能，調節翻譯和mRNA的穩定性）。此外，piRNA在一些癌癥細胞中存在異常表達的現象，提示piRNA可能參與癌癥的發生，并可作為癌癥診斷和治療中的潛在生物標記物。
C. siRNA：內源性干擾小RNA（siRNA, Small interfering RNA），包括ta-siRNA、ra-siRNA和nat-siRNA。ta-siRNA：天然反義轉錄小干擾RNA，由TAS基因編碼，miRNA剪切產生，21nt，作用機制類似于miRNA；ra-siRNA：由重復序列、轉座子、異染色質產生，多為24nt；nat-siRNA：由天然反義轉錄本（序列與同區域互補鏈上基因的mRNA方向相反且發生部分重疊）產生。siRNA的功能主要與植物脅迫和生物發育相關。

分析流程

生物信息學分析：

去載體后測序質量圖

文氏圖

分層聚類

網絡調控互作圖

樣品要求
樣品類型：細胞、新鮮組織或RNA樣品；
樣品的量：細胞樣品請提供至少1×10⁷個細胞，組織樣品請提供至少300mg的組織塊或切片，RNA樣品請提供2 μg以上的總RNA；
樣品質量：RNA無明顯降解，提取的總RNA OD260/280值在1.8~2.2之間，濃度≥ 500 ng/μl，28S:18S ≥ 1.5，RIN ≥ 7；
樣品保存：細胞樣品或新鮮組織塊（切成~50mg的小塊）可用TRIZOL或RNA保護劑處理或液氮凍存后，-80℃保存，RNA樣品可溶于乙醇或RNA-free的超純水中，-80℃保存。樣品保存期間避免反復凍融；
樣品運輸：樣品置于1.5 ml管中，封口膜封好，干冰運輸。