轉錄組測序的研究對象為特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有RNA的總和,包括mRNA和非編碼RNA。通過轉錄組測序,能夠全面獲得物種特定組織或器官的轉錄本信息,從而進行轉錄本結構研究、變異研究、基因表達水平研究以及全新轉錄本發現等研究。
技術優勢
和芯片相比,不僅可檢測低豐度的基因表達,更可全面的發現可變剪切、融合基因、RNA編輯等芯片無法檢測到的結構變異。
分析流程
生物信息學分析:
基因組特征區域測序讀數分布情況
基因組比對
可變剪切
火山圖
分層聚類
疾病基因關聯熱圖
差異基因互作網絡圖
GO聚類分析
樣品要求
樣品類型:細胞、新鮮組織或RNA樣品;
樣品的量:細胞樣品請提供至少1×107個細胞,組織樣品請提供至少300mg的組織塊或切片,RNA樣品請提供2
μg以上的總RNA;
樣品質量:RNA無明顯降解,提取的總RNA OD260/280值在1.8~2.2之間,濃度≥ 500 ng/μl,28S:18S ≥ 1.5,RIN ≥
7;
樣品保存:細胞樣品或新鮮組織塊(切成~50mg的小塊)可用TRIZOL或RNA保護劑處理或液氮凍存后,-80℃保存,RNA樣品可溶于乙醇或RNA-free的超純水中,-80℃保存。樣品保存期間避免反復凍融;
樣品運輸:樣品置于1.5 ml管中,封口膜封好,干冰運輸。
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