原理：

甲基化特異性的PCR是一種靈敏度高且操作相對簡單的甲基化研究方法。重亞硫酸鹽處理DNA后，基因組DNA發生的由甲基化狀態決定的序列改變。隨后進行引物特異性的PCR。該方法引物設計是關鍵。MSP中設計兩對引物，即一對結合處理后的甲基化DNA鏈（引物對M），另一對結合處理后的非甲基化DNA鏈（引物對U）。檢測MSP擴增產物，如果用引物M能擴增出片段，則說明檢測位點存在甲基化；若用引物U擴增出片段，則說明被檢測的位點不存在甲基化。

該方法優點是：檢測靈敏度高，樣品消耗少，僅需1μg的基因組DNA，可用于石蠟包埋樣本；快速、簡單，省時。

MSP流程示意圖

用亞硫酸鹽處理后DNA分子發生了由甲基化狀態決定的序列改變。用甲基化特異性的引物（primer M）和非甲基化特異性的引物（primer U）進行擴增。只有結合完全的甲基化或非甲基化特異性引物的片段才能得到擴增。

信號通路磷酸化抗體芯片	蛋白表達差異篩選抗體芯片
細胞因子抗體芯片（定量）	細胞因子抗體芯片（A系列）	細胞因子抗體芯片（L系列）
GC/MS	NMR	LC/MS
PGM＆#8482;測序	數字PCR	焦磷酸測序